Die Kirchengemeinde Bonndorf umfasst die Ortsteile Ebnet, Wellendingen und Wittlekofen der Stadt Bonndorf:
- Bonndorf, St. Peter und Paul, 2.575 Katholiken
- Wellendingen, St. Nikolaus, 422 Katholiken
- Wittlekofen, St. Nikolaus, 187 Katholiken
In allen drei Gemeinden werden regelmäßig Sonntags- und Festgottesdienste gefeiert, wobei in Bonndorf in der Regel jeden Sonntag ein Gottesdienst stattfindet. Bonndorf bildet mit der größten Kirche das Zentrum der Gemeinde.

Neben der Pfarrkirche St. Peter und Paul befindet sich das Pfarrhaus. Im EG des Pfarrhauses ist das Pfarrbüro der Seelsorgeeinheit sowie ein kleines Sitzungszimmer untergebracht. Weiterhin befindet sich im Haus eine Wohnung für den Pfarrer mit Appartement für die Haushälterin.
Für die Pfarrkirche, den Kirchvorplatz und das Pfarrhaus trägt das Land Baden Württemberg die Baupflicht.
Als zentrales Gemeindezentrum wurde 1976 oberhalb der Kirche das Paulinerheim erbaut. Im EG befinden sich drei unterschiedlich große Räume, ein kleiner Abstellraum, die Toiletten und eine kleine Küche. Sowohl die Räume als auch der großzügig gestaltete Flur werden von verschiedenen kirchlichen Gruppierungen der Seesorgeeinheit regelmäßig genutzt. Auf Anfrage werden die Räume bei Verfügbarkeit auch für private oder gewerbliche Zwecke zur Verfügung gestellt.
Im OG ist ein großer Veranstaltungssaal mit Bühne und eine große Küche mit Kühlraum untergebracht. Der Saal bietet Sitzplätze für bis zu 150 Personen. Die Vermietung des Saales erfolgt über das Pfarrbüro und ist für kirchliche Gruppierungen immer möglich. Bei privaten oder gewerblichen Nutzungen erfolgt die Vermietung nach Rücksprache mit dem Pfarrgemeinderat.
Auf der Bühne steht ein Flügel für Konzerte zur Verfügung. Weiterhin ist der Saal mit einer Leinwand, Beamer, Lautsprechern, Mischpult und Mikrophonen technisch gut ausgestattet.
Ein kleiner Anbau im EG wird für Durchwanderer als Appartement mit zwei Schlafmöglichkeiten, Dusche und Küchenzeile über das Pfarrbüro zur Verfügung gestellt. Im hinteren Teil des Anbaus befindet sich zusätzlich ein Lagerraum, in welchem u.a. ein Zelt, welches an das Paulinerheim angebaut werden kann, untergebracht ist.
Neben der Pfarrkirche am Kirchplatz befindet sich das Vinzentiushaus. In diesem Haus ist eine Wohnung untergebracht, welche momentan von dem zweiten Pfarrer bewohnt wird. Im EG befindet sich zusätzlich der Proberaum des Kirchenchores. Durch einen separaten Eingang erreicht man weitere Räume, welche regelmäßig von den Ministranten und der KJG für Gruppenstunden, als Umkleideräume und sonstige Aktivitäten genutzt werden.
1727 erbaute Abt Blasius III. in der Nähe des Schlosses die Schlosskapelle, welche vom Konstanzer Bischof geweiht wurde. Als Patrone gelten der heilige Blasius von Sebaste und der heilige Nikolaus. Die Kapelle wurde Anfang des 19. Jahrhunderts abgebaut und originalgetreu an ihrem heutigen Standort im Stadtgarten bei der Grundschule wieder aufgebaut. Die in den Steinen eingeschlagenen Zahlen stammen von diesem Umzug und sind heute noch sichtbar. In der Schlosskapelle werden im Sommer Werktagsmessen gehalten. Die Kapelle ist im Besitz der Stadt Bonndorf.
Im Senioren- und Pflegeheim befindet sich die Kapelle des Heiligen Laurentius.
St. Laurentius ist nicht nur Namensgeber des Pflegeheimes, sondern auch die hauseigene Kapelle ist ihm geweiht. Sie lädt jederzeit zum Gebet oder zum stillen Verweilen ein.
Hier werden regelmäßig katholische und evangelische Gottesdienste gefeiert. Die Geistlichen besuchen und betreuen auf Wunsch die Bewohner auch in ihren Wohnräumen. Diese Kapelle ist ein Eckpfeiler der Seniorenbetreuung in unserer Seelsorgeeinheit.
Generell bildet Bonndorf mit seinen vielzähligen Einrichtungen, Gruppierungen und Angeboten das Zentrum der Seelsorgeeinheit, jedoch findet auch in den Ortsteilen ein sehr aktives und lebendiges Gemeindeleben statt.

